Au cœur du Projet Niantic, des scientifiques ont découvert une substance pouvant interagir avec le cerveau humain. Cette substance nommée "Exotic Matter" (Matière XM), existe depuis l'antiquité, influant l'esprit humain et les progrès de l'humanité. Cette découverte a provoqué une bataille dans laquelle de puissantes nations et organisations s'opposent dans le but d'exploiter cette substance. Cela représente à la fois une opportunité et une menace pour l'humanité. Dans ce tumulte, deux grandes factions sont représentées et cherchent à contrôler la Matière XM et par la même occasion, le destin de l'humanité : les Éclairés qui voient en le pouvoir de la Matière XM un cadeau qui améliore l'expérience humaine et la découverte, et la Résistance qui la considère comme quelque chose d'hostile qui contrôle l'esprit humain et se tournant donc vers la technologie comme moyen d'avancer.

Nitta Yoshifumi est un jeune yakuza qui gère ses affaires avec rigueur dans le secteur qu'il occupe. Mais un jour débarque Hina, une jeune fille dotée de pouvoirs télékinétiques. Elle oblige Nitta à l'accueillir chez lui, mettant ainsi fin à sa vie tranquille et bien rodée, car si les pouvoirs de Hina sont parfois utiles à Nitta, elle a aussi tendance à en perdre le contrôle. Malgré ces désagréments, notre yakuza prend soin de la fillette. Que peut-il advenir de cet étrange arrangement ?

En la ciudad de Ōarai, en la prefectura de Ibaraki, Masaki Hinaoka se hace amigo del estudiante transferido Shō Akitsuki antes de las vacaciones de verano, y termina enganchado al surf. A través del deporte, Masaki conocerá nuevos amigos y también se distanciará de ellos en su viaje a la edad adulta.

Subaru Mikazuki est un romancier timide qui lutte pour garder une vie sociale et aller à la rencontre des gens. Par un heureux hasard, il partage son quotidien avec un chat abandonné qu'il a recueilli dans la rue. Chacun d'entre eux n'a pas vécu des jours très heureux. C'est l'histoire de deux êtres un peu perdus qui vont se reconstruire et dont on partage la vie, tantôt à travers le regard d'un homme, tantôt à travers celui d'un chat.